Baseclear NGS Library prep automation with the Tecan Dreamprep NGS 780

Baseclear is een CRO sequencing bedrijf. Voor Next Generation Sequecing (NGS) gebruiken wij de Illumina en ONT platformen. Library preparation is een grote en belangrijke stap binnen de NGS, omdat hier de samples worden voorbereid en barcodes aan de samples worden gehangen. Gezien de sensitiviteit van sequencing instrumenten is het uitermate belangrijk dat dit proces zo schoon mogelijk wordt uitgevoerd, en dat er geen sample verwisselingen plaatsvinden. Aangezien wij veel samples tegelijk verwerken voor onze klanten, is er naast de manuele lasten ook dus een groot risico op contaminatie. Vandaar dat wij dit proces hebben geautomatiseerd. Op dit moment hebben wij voor twee library prep kits het proces geautomatiseerd. Voornamelijk op de doorvoer en kwaliteit zien wij een grote verbetering. Als voorbeeld, voor 1 FTE is de doorvoer verhoogd van 1 plaat per dag naar 3 platen per dag.

– Pascal Bus –