Proteonano™ Phosphopeptide Enrichment Kit voor phosphoproteomics
Bij proteomics draait het niet alleen om welke eiwitten aanwezig zijn. Soms is het ook belangrijk om te weten hoe eiwitten worden gereguleerd.
Een belangrijke vorm van regulatie is fosforylering. Hierbij wordt een fosfaatgroep aan een eiwit toegevoegd. Dit speelt een rol bij veel biologische processen, zoals celsignalering, groei en reactie op stress.
Voor onderzoek naar deze processen gebruiken labs vaak phosphoproteomics. Daarbij worden gefosforyleerde peptiden onderzocht met LC-MS/MS.
Waarom verrijking belangrijk is
Gefosforyleerde peptiden komen vaak in lage hoeveelheden voor. Daardoor kunnen ze lastig te meten zijn in complexe biologische samples.
Daarom is een goede verrijkingsstap belangrijk. Deze stap helpt om gefosforyleerde peptiden uit het sample te halen. Zo worden ze beter zichtbaar in de LC-MS/MS-analyse.
Voor labs die werken met phosphoproteomics kan deze stap veel invloed hebben op de kwaliteit van de data.
Wat doet de Proteonano™ Phosphopeptide Enrichment Kit?
De Proteonano™ Phosphopeptide Enrichment Kit is ontwikkeld voor de verrijking van gefosforyleerde peptiden.
De kit maakt gebruik van TiO₂ affinity media. Dit materiaal bindt gefosforyleerde peptiden. Daarna kunnen deze peptiden worden gewassen en weer van het materiaal worden gehaald.
Volgens de productinformatie van MS Wil is de kit ontwikkeld voor selectieve verrijking. Dit betekent dat de kit gericht is op het vangen van gefosforyleerde peptiden, met zo min mogelijk niet-specifieke binding.
Een eenvoudige kolomworkflow
De column kit gebruikt een kant-en-klaar tipformaat. Peptiden worden op de TiO₂ tips geladen. Daarna volgt een bind-wash-elute workflow.
Dit betekent:
binden van gefosforyleerde peptiden
wassen om storende stoffen te verwijderen
elueren van de verrijkte peptiden
De verrijkte peptiden kunnen daarna worden geanalyseerd met LC-MS/MS.
Deze workflow is bedoeld voor labs die diepe en reproduceerbare phosphoproteomics-analyse willen uitvoeren op complexe biologische samples.
Data-highlights
Op de productpagina van MS Wil worden de volgende data-highlights genoemd:
23.000+ phosphopeptides
ongeveer 85% phosphorylation enrichment efficiency
29.000+ phosphosites
Deze waarden laten zien dat de kit is ontwikkeld voor diepe phosphoproteomics-analyse.
Onderdeel van een bredere sample prep workflow
De keuze voor phosphopeptide enrichment hangt af van de toepassing. Ook het sampletype, de hoeveelheid materiaal en de gewenste diepte spelen een rol.
Daarom is het belangrijk om niet alleen naar één product te kijken. De beste keuze hangt af van de hele workflow.
MS Wil ondersteunt Europese laboratoria bij het vinden van passende sample prep-oplossingen. Binnen het bredere sample prep portfolio zijn verschillende routes beschikbaar. Denk aan protein enrichment, plasma enrichment, digestion en peptide enrichment.
Praktische ondersteuning door MS Wil
Voor labs die phosphoproteomics willen uitvoeren, kan de Proteonano™ Phosphopeptide Enrichment Kit een praktische route zijn.
De kit helpt bij de verrijking van gefosforyleerde peptiden voor LC-MS/MS-analyse. Dit kan nuttig zijn voor onderzoek naar celsignalering, biomarker discovery en andere biologische processen waarbij fosforylering een rol speelt.
Meer informatie over de Proteonano™ Phosphopeptide Enrichment Kit is beschikbaar via de productpagina van MS Wil:
https://www.mswil.com/sample-prep/proteonano-phosphopeptide-enrichment-kitcolumn/