S-Trap™ sample prep voor betrouwbare proteomics workflows

Een goede LC-MS/MS-analyse begint niet pas bij de massaspectrometer. De voorbereiding van het monster is minstens zo belangrijk.

Bij proteomics moeten eiwitten goed worden opgelost, gezuiverd en verteerd. Als deze stap niet goed verloopt, kan dit invloed hebben op de kwaliteit van de data. Ook kunnen stoffen zoals zouten, detergenten of buffers de analyse verstoren.

S-Trap™ sample prep helpt om deze stap eenvoudiger en beter controleerbaar te maken.

Waarom sample prep belangrijk is

Veel laboratoria werken met complexe monsters. Denk aan cellen, weefsels, plasma of andere biologische samples. Deze monsters bevatten vaak stoffen die de LC-MS/MS-analyse kunnen beïnvloeden.

Daarom is een goede sample prep-stap belangrijk. Deze stap helpt om eiwitten klaar te maken voor verdere analyse. Ook helpt het om storende stoffen te verwijderen.

Voor labs die betrouwbare proteomics-data willen, is dit een belangrijk onderdeel van de workflow.

Wat doet S-Trap™?

S-Trap™ is ontwikkeld voor eiwitdigestie in proteomics workflows. De methode maakt het mogelijk om eiwitten eerst goed op te lossen met SDS. SDS is een sterke stof die helpt om eiwitten, waaronder membraaneiwitten, goed in oplossing te brengen.

Daarna worden de eiwitten vastgehouden in de S-Trap™. Storende stoffen, zoals detergenten, zouten, PEG, glycerol en buffers, kunnen vervolgens worden verwijderd.

Na deze wasstappen wordt een protease toegevoegd. Dit enzym verteert de eiwitten tot peptiden. Deze peptiden kunnen daarna worden gebruikt voor LC-MS/MS-analyse.

Verschillende formaten

Niet elk lab verwerkt dezelfde hoeveelheid sample. Daarom is S-Trap™ beschikbaar in meerdere formaten.

De S-Trap™ Micro Columns zijn geschikt voor kleinere hoeveelheden eiwit. De Mini Columns zijn bedoeld voor middelgrote samples. Voor grotere hoeveelheden zijn er Midi Columns.

Voor labs die veel samples tegelijk verwerken, zijn er ook 96-well plates. Deze zijn geschikt voor high-throughput workflows en kunnen helpen om de voorbereiding van grotere aantallen samples makkelijker te maken.

De S-Trap™ productlijn bestaat onder meer uit:

• Micro Columns
• Mini Columns
• Midi Columns
• 96-well Micro Plates
• 96-well Mini Plates
• complete kits met benodigde oplossingen

Een praktische workflowkeuze

De keuze voor sample prep hangt af van het type sample, de hoeveelheid eiwit en het aantal samples. Ook de bestaande LC-MS/MS-opstelling speelt een rol.

Daarom is sample prep niet alleen een productkeuze. Het is vooral een workflowkeuze.

MS Wil ondersteunt Europese laboratoria bij het vinden van een passende route. Dit kan gaan om eiwitdigestie, protein enrichment, peptide enrichment of andere stappen binnen de LC-MS/MS-workflow.

Binnen het bredere sample prep portfolio biedt MS Wil verschillende oplossingen voor proteomics labs.

Praktische ondersteuning door MS Wil

MS Wil levert specialistische producten voor sample preparation, LC-MS/MS en mass spectrometry. Daarbij ligt de nadruk op praktische ondersteuning, keuzevrijheid en producten die passen binnen bestaande workflows.

Voor labs die hun proteomics sample prep willen verbeteren, kan S-Trap™ een praktische oplossing zijn. Het helpt om eiwitten efficiënt voor te bereiden voor LC-MS/MS-analyse, zonder dat een volledig nieuwe workflow nodig is.

Meer informatie over S-Trap™ is beschikbaar via de productpagina van MS Wil:
https://www.mswil.com/sample-prep/s-trap/